RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533834.1

RNPC3-209, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RNPC3, Length 3,658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-209ENST00000533834 UBOX5O94941 541 aa7.5□□□□□ -1.21
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RNPC3-209ENST00000533834 ISL2Q96A47 359 aa7.49□□□□□ -1.21
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