RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491833.5

SSR4-212, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 921 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-212ENST00000491833 WNT7BP56706 349 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SFR1Q86XK3 245 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ALLCQ8N6M5 410 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 RLN3Q8WXF3 142 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 FAM213AQ9BRX8 229 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 LHX6Q9UPM6 363 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ANTXRLA6NF34 631 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 H3BQV1 296 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 GABRDO14764 452 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 HCRTO43612 131 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 APODP05090 189 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TIE1P35590 1138 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 LONP1P36776 959 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 RING1Q06587 406 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 RESTQ13127 1097 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 GAB4Q2WGN9 574 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SPDYCQ5MJ68 293 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 EOGTQ5NDL2 527 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 VSTM1Q6UX27 236 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 MYLPFQ96A32 169 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SAAL1Q96ER3 474 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SPATA17Q96L03 361 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 FNBP1Q96RU3 617 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 PNKPQ96T60 521 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SYT15Q9BQS2 421 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 KLK13Q9UKR3 277 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 H0Y626 953 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SGK1O00141 431 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 PPP1R37O75864 691 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 KAT7O95251 611 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TRIM16O95361 564 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 BMP15O95972 392 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 CFIP05156 583 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ANXA13P27216 316 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 HOXD12P35452 270 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 PTGER3P43115 390 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ZXDBP98169 803 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 DHCR24Q15392 516 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 HMGB4Q8WW32 186 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 TMEM74BQ9NUR3 256 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 EHD2Q9NZN4 543 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 SEL1LQ9UBV2 794 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 CPQQ9Y646 472 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-212ENST00000491833 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 ADH1CP00326 375 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 DDIT3P35638 169 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 GRIK1P39086 918 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 SLC7A9P82251 487 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 RBP5P82980 135 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 KDSRQ06136 332 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 MYO1EQ12965 1108 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 SEMA3BQ13214 749 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 FAM171BQ6P995 826 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 DYMQ7RTS9 669 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 PIP4P1Q86T03 277 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 PGBD3Q8N328 593 aa15.45■□□□□ 0.06
SSR4-212ENST00000491833 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms