RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 B3GNT5Q9BYG0 378 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 SDCBP2Q9H190 292 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQ27 194 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQ64 194 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQD8 194 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 F8VP50 259 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 RHOBTB3O94955 611 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 HOXC13P31276 330 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 CXCL12P48061 93 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 AP3M2P53677 418 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 CDH8P55286 799 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 NOP14P78316 857 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 DMWDQ09019 674 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM196Q5HYL7 178 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 TRPC7Q9HCX4 862 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 SPAG17Q6Q759 2223 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 CACNA1AO00555 2505 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 USP17L7P0C7H9 530 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 TCF3P15923 654 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 RAP1GAPP47736 663 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 NCOA4Q13772 614 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 MTF1Q14872 753 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZACNQ401N2 412 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 FSTL4Q6MZW2 842 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN5O00501 218 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM66O15016 1216 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 BIRC3Q13489 604 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF699Q32M78 642 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 PKN3Q6P5Z2 889 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 PAQR9Q6ZVX9 377 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 SYNPOQ8N3V7 929 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 TMC2Q8TDI7 906 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 A8MXQ7 604 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 PHACTR2O75167 634 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 CKMP06732 381 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 PDGFRLQ15198 375 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 NFIL3Q16649 462 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 FSIP1Q8NA03 581 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 OSCP1Q8WVF1 389 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF840PA6NDX5 716 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 OLFM2O95897 454 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 NRLP54845 237 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 EML3Q32P44 896 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF667Q5HYK9 610 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 SV2AQ7L0J3 742 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA2013Q8IYS2 634 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 MAPK13O15264 365 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 PFKLP17858 780 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 HDCP19113 662 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ANXA13P27216 316 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 GJA4P35212 333 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 PPP2R5DQ14738 602 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 SH3RF2Q8TEC5 729 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 RNF38Q9H0F5 515 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ECT2Q9H8V3 914 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 WNT6Q9Y6F9 365 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 IKBKBO14920 756 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF202O95125 648 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 KCNB1Q14721 858 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ZCWPW2Q504Y3 356 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 AKAP3O75969 853 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 ASS1P00966 412 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 OAS1P00973 400 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 TGM1P22735 817 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 TAF10Q12962 218 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 CEP135Q66GS9 1140 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 FAM35AQ86V20 835 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 FUKQ8N0W3 1084 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 KCNK16Q96T55 309 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00597Q9H2U6 94 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 HMGXB4Q9UGU5 601 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXB3-211ENST00000490677 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 TNFRSF10BO14763 440 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 EGFP01133 1207 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXB3-211ENST00000490677 HOXA6P31267 233 aa29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms