RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 GRM1Q13255 1194 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 MIIPQ5JXC2 388 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 MZT2AQ6P582 158 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 KRT73Q86Y46 540 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.9□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.9□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 LNX2Q8N448 690 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 SSH3Q8TE77 659 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 MUL1Q969V5 352 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.89□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.89□□□□□ -1.47
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CCL20-204ENST00000489160 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF1AP19438 455 aa5.88□□□□□ -1.47
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CCL20-204ENST00000489160 NXPH1P58417 271 aa5.88□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 CCNIQ14094 377 aa5.88□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 KCNAB1Q14722 419 aa5.88□□□□□ -1.47
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CCL20-204ENST00000489160 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
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CCL20-204ENST00000489160 PROM1O43490 865 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 COQ9O75208 318 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 ITGAMP11215 1152 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 EGR1P18146 543 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 ATICP31939 592 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 BLOC1S1P78537 153 aa5.87□□□□□ -1.47
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF747Q9BV97 191 aa5.87□□□□□ -1.47
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CCL20-204ENST00000489160 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 PPCSQ9HAB8 311 aa5.87□□□□□ -1.47
CCL20-204ENST00000489160 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.87□□□□□ -1.47
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