RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486032.1

COPS3-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-208ENST00000486032 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TMEM270Q6UE05 265 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ACOT1Q86TX2 421 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SPC24Q8NBT2 197 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 LMO3Q8TAP4 145 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TAF4BQ92750 862 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 KREMEN1Q96MU8 473 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SPAG5Q96R06 1193 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 LPIN3Q9BQK8 851 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 MED10Q9BTT4 135 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ZBP1Q9H171 429 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 DPEP3Q9H4B8 488 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SIX2Q9NPC8 291 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CISHQ9NSE2 258 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GDAP2Q9NXN4 497 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 FBXL5Q9UKA1 691 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 DSEQ9UL01 958 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CDY1Q9Y6F8 540 aa6□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 VWA8A3KMH1 1905 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 MYO9BQ13459 2157 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 A0A1W2PRU2 124 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CLDN5O00501 218 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 PMM2O15305 246 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ADAM12O43184 909 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GFPT2O94808 682 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ADCY5O95622 1261 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 UCHL3P15374 230 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 FOSL2P15408 326 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TYMPP19971 482 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ADORA2BP29275 332 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 OR1D2P34982 312 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 NRIP1P48552 1158 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 LHX1P48742 406 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ZNF75DP51815 510 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CTBSQ01459 385 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TSPY1Q01534 308 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CYP27A1Q02318 531 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 DSG1Q02413 1049 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 UBE3AQ05086 875 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 PTPN14Q15678 1187 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CCDC142Q17RM4 750 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SLC39A12Q504Y0 691 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 JAKMIP2Q96AA8 810 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TWNKQ96RR1 684 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 RTP3Q9BQQ7 232 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SYT15Q9BQS2 421 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 BCO2Q9BYV7 579 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ELOVL4Q9GZR5 314 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GANQ9H2C0 597 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TLE6Q9H808 572 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 CYP3A43Q9HB55 503 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GPAMQ9HCL2 828 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 LZTS1Q9Y250 596 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 NME7Q9Y5B8 376 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.99□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 A0A1W2PQC6 194 aa5.98□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.98□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.98□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 OR6C75A6NL08 312 aa5.98□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 FSCN2O14926 492 aa5.98□□□□□ -1.45
COPS3-208ENST00000486032 TEX28O15482 410 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms