RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475651.5

RBM39-229, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 5

Gene RBM39, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-229	ENST00000475651	MAP2K7	O14733	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PRODH	O43272	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	KCNQ2	O43526	872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	DLX3	O60479	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MSC	O60682	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GJB6	O95452	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	SERPING1	P05155	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FGFR1	P11362	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ACTN2	P35609	894 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	USP14	P54578	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	VSNL1	P62760	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	TNNC1	P63316	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	APBA1	Q02410	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PICALM	Q13492	652 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CASP8	Q14790	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GPR19	Q15760	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ASIC2	Q16515	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	IL17A	Q16552	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MEA1	Q16626	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	RAD54L	Q92698	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PIGS	Q96S52	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CHP1	Q99653	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GLI3	P10071	1580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	LRP5	O75197	1615 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FLT1	P17948	1338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PRLR	P16471	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	KLRK1	P26718	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PTGS2	P35354	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ADCY8	P40145	1251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	GRIA2	P42262	883 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	KIF11	P52732	1056 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CETN1	Q12798	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	FOXL1	Q12952	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	STK4	Q13043	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	NPY5R	Q15761	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CLUL1	Q15846	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	VPS72	Q15906	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CRY1	Q16526	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-229	ENST00000475651	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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