RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FAF2Q96CS3 445 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CNPY3Q9BT09 278 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PLVAPQ9BX97 442 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SNX24Q9Y343 169 aa5.95□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 E5RJQ4 531 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PI4K2BG5E9Z4 385 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 M0QYV0 167 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HCRTO43612 131 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF623O75123 536 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TCEA3O75764 348 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 CD4P01730 458 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GNAT1P11488 350 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 RARGP13631 454 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 KRT17Q04695 432 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 MYO1EQ12965 1108 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CD300LGQ6UXG3 332 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 DPH6Q7L8W6 267 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A9Q7LBE3 791 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ALLCQ8N6M5 410 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BEST2Q8NFU1 509 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATL2Q8NHH9 583 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 PARP2Q9UGN5 583 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRC-210ENST00000462363 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PLXNA3P51805 1871 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PCNTO95613 3336 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KPNA7A9QM74 516 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RIPK2O43353 540 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SHBGP04278 402 aa5.93□□□□□ -1.46
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