RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 SDSP20132 328 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 TFAP4Q01664 338 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 STXBP2Q15833 593 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 USH1GQ495M9 461 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 VPS52Q8N1B4 723 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 MDM1Q8TC05 714 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 USP33Q8TEY7 942 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 GLG1Q92896 1179 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 ZNF558Q96NG5 402 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 RMDN3Q96TC7 470 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 ADAM2Q99965 735 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 ZBP1Q9H171 429 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 SPG21Q9NZD8 308 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CLUHO75153 1309 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NRCAMQ92823 1304 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 A0A0D9SFI3 127 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 TSPY2A6NKD2 308 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 K7ESF4 209 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KCNH1O95259 989 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 IGHDP01880 384 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 DBHP09172 617 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CLCN4P51793 760 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 FAM193AP78312 1265 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 IGBP1P78318 339 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NTHL1P78549 312 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 FAM189BP81408 668 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 SP4Q02446 784 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KRT17Q04695 432 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NR1I3Q14994 352 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CCDC96Q2M329 555 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KBTBD6Q86V97 674 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 SPATA18Q8TC71 538 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 DCAF4Q8WV16 495 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KCNC2Q96PR1 638 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KXD1Q9BQD3 176 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 LGR4Q9BXB1 951 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 COL12A1Q99715 3063 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NOTCH4Q99466 2003 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NOTCH2Q04721 2471 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 ZNF213O14771 459 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 INPPL1O15357 1258 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 B4GALT3O60512 393 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 EPN2O95208 641 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CYBBP04839 570 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 SNHG28P0DPA3 235 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 CTSAP10619 480 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 KRT10P13645 584 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-204ENST00000461018 PAMP19021 973 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms