RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDH9Q9ULB4 789 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP18Q9UMW8 372 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDF9O60383 454 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRP3O75074 770 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNNC2P02585 160 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDGFRBP09619 1106 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L7P0C7H9 530 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNR2P34972 360 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPRD1P41143 372 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASP4P49662 377 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2J2P51589 502 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMNB2Q03252 620 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MESP2Q0VG99 397 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP2R5DQ14738 602 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSTM1Q6UX27 236 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF38Q9H0F5 515 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDCBP2Q9H190 292 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 KNL1Q8NG31 2342 aa9.03□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXNA2O75051 1894 aa9.02□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 F8VP50 259 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN5O00501 218 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 VNN1O95497 513 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CKMP06732 381 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNNI1P19237 187 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 AFMP43652 599 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAP1GAPP47736 663 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYL6P60660 151 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN10P78369 228 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP8P85298 464 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO1EQ12965 1108 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK4Q13043 487 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDGFRLQ15198 375 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSRP2Q16527 193 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 KBTBD6Q86V97 674 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQUBQ8NA54 791 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAB3Q8WWW8 586 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf48Q96LL4 319 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 HHIPQ96QV1 700 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMAC2Q9NW81 257 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.02□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.01□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.01□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.01□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7EQS6 105 aa9.01□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEFTY2O00292 366 aa9.01□□□□□ -0.97
GAPDHP28-201ENST00000455134 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms