RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443253.1

BBX-212, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 5

Gene BBX, Length 238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-212ENST00000443253 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 KCNA3P22001 575 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ACVR2AP27037 513 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 IL1R2P27930 398 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 LRPAP1P30533 357 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 DGKEP52429 567 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 KRT17Q04695 432 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 BTKQ06187 659 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 MYO1EQ12965 1108 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ARHGEF7Q14155 803 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SLC29A2Q14542 456 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 NPY5RQ15761 445 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ARL13BQ3SXY8 428 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 FCRL6Q6DN72 434 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 C1orf228Q6PIY5 440 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 YAF2Q8IY57 180 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 FAM109AQ8N4B1 249 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SSH3Q8TE77 659 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 OSBPL9Q96SU4 736 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 TOR3AQ9H497 397 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CDC23Q9UJX2 597 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 A0A087WZ62 844 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CLCA1A8K7I4 914 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 IKBKBO14920 756 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 AREL1O15033 823 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CCP110O43303 1012 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PPFIA4O75335 1185 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PPP3CBP16298 524 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PPM1AP35813 382 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 HSPA7P48741 367 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CPT1AP50416 773 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ITGA8P53708 1063 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 MAPK10P53779 464 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SATB1Q01826 763 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 INSCQ1MX18 579 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 MPEG1Q2M385 716 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 BEND5Q7L4P6 421 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 LPIN2Q92539 896 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 LRRC46Q96FV0 321 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.99□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PIPSLA2A3N6 862 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 INMTO95050 263 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 RASAL1O95294 804 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CSF1RP07333 972 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PDHA1P08559 390 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SRGNP10124 158 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ITGAMP11215 1152 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 TPH1P17752 444 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PRKAG1P54619 331 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SP2Q02086 613 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 STK3Q13188 491 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 E2F2Q14209 437 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 ICE2Q659A1 982 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
BBX-212ENST00000443253 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.98□□□□□ -1.77
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