RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 PEBP4Q96S96 227 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNPY3Q9BT09 278 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 CALN1Q9BXU9 219 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM49BQ9NUQ9 324 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCN1AP35498 2009 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.5■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 C2CD4BA6NLJ0 364 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 AKAP5P24588 427 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP5DP30049 168 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MORF4L2Q15014 288 aa26.5■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 TCEA3O75764 348 aa26.49■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 RAB6CQ9H0N0 254 aa26.49■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNTN3Q9P232 1028 aa26.49■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 GDF10P55107 478 aa26.48■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CHMP6Q96FZ7 201 aa26.48■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 C9orf57Q5W0N0 161 aa26.48■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.48■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSEN2P49810 448 aa26.47■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CCL14Q16627 93 aa26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PKDCCQ504Y2 493 aa26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPLX4Q7Z7G2 160 aa26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 GJD2Q9UKL4 321 aa26.47■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa26.46■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 TREHO43280 583 aa26.46■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 APOC2P02655 101 aa26.46■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CFAP57Q96MR6 1250 aa26.46■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 TBK1Q9UHD2 729 aa26.46■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 ADAM17P78536 824 aa26.46■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 MMRN1Q13201 1228 aa26.46■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.46■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLK14Q9P0G3 267 aa26.46■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA0754O94854 1291 aa26.45■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 AXLP30530 894 aa26.45■■□□□ 1.83
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP11AP98196 1134 aa26.45■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC14Q49A88 953 aa26.45■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP4X1Q8N118 509 aa26.45■■□□□ 1.83
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PLEKHF1-201ENST00000436066 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRPSAP2O60256 369 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH16O75309 829 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 BEX3Q00994 111 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 IRF5Q13568 498 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 CST9Q5W186 159 aa26.45■■□□□ 1.82
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCGF5Q86SE9 256 aa26.45■■□□□ 1.82
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