RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGTP01019 485 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LMO2P25791 158 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADORA2BP29275 332 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDH6P55285 790 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC13Q8IYE1 715 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP3A43Q9HB55 503 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HMGCRP04035 888 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC130P13994 396 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HUNKP57058 714 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CORO7P57737 925 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERMARDQ5T6L9 678 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CST9Q5W186 159 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBED8Q8IZ13 594 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM71DQ8N9W8 422 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GDAP1Q8TB36 358 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCRS1Q96EZ8 462 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GABBR2O75899 941 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRT7P08729 469 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF410Q86VK4 478 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNX27Q96L92 541 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VPS37BQ9H9H4 285 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM120BA0PK00 339 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A8MXQ7 604 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPTLC1O15269 473 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INCA1Q0VD86 236 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MPP2Q14168 576 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MFSD10Q14728 455 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMED2Q15363 201 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPD1P21695 349 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RABGGTBP53611 331 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CA9Q16790 459 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOTUMQ6P988 496 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPATA18Q8TC71 538 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCN4AP35499 1836 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A6NJR5 290 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F2P00734 622 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VIMP08670 466 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FGFR1P11362 822 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LCP1P13796 627 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COPS2P61201 443 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAV1Q03135 178 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LMNB2Q03252 620 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MSS51Q4VC12 460 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLNQ7Z5Q5 900 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NETO2Q8NC67 525 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBP3P10745 1247 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNX17Q15036 470 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC14Q49A88 953 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms