RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LAMC2Q13753 1193 aa15.03■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 EFHBQ8N7U6 833 aa15.03■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.03■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 E7ENQ6 273 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 E9PBE3 544 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL41O60662 606 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 CTSHP09668 335 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 PYGMP11217 842 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 RARGP13631 454 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 TKFCQ3LXA3 575 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 ECSITQ9BQ95 431 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -02e-8■□□□□ 10.2
PTPRU-204ENST00000428026 STMN3Q9NZ72 180 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 ADM5C9JUS6 153 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF263O14978 683 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 HMBSP08397 361 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 PTPN4P29074 926 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.02■□□□□ -0
PTPRU-204ENST00000428026 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ARIH2O95376 493 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 IL1R1P14778 569 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PON1P27169 355 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TTC30AQ86WT1 665 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TNIP3Q96KP6 325 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GLRBP48167 497 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NUP107P57740 925 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PTPAQ15257 358 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RGL2O15211 777 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CYTH3O43739 400 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM153BP0C7A2 387 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FAM153CQ494X1 144 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC6Q86X45 466 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GPC2Q8N158 579 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CASP10Q92851 521 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H2ADP20671 130 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PPP3CCP48454 512 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ANGPT1Q15389 498 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MIER2Q8N344 545 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PAFAH2Q99487 392 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 APOL5Q9BWW9 433 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GPD1P21695 349 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 STX5Q13190 355 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM51Q9NW97 253 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 WNT10BO00744 389 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 THRAP10827 490 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PTGER2P43116 358 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 EFNA5P52803 228 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FLCNQ8NFG4 579 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 OPTNQ96CV9 577 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HES6Q96HZ4 224 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GRIK1P39086 918 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 FCGRTP55899 365 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF560Q96MR9 790 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 VPS33BQ9H267 617 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MEI4A8MW99 385 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 PARNO95453 639 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SNX30Q5VWJ9 437 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms