RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.08□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRJQ12913 1337 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFKLP17858 780 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPRD1P41143 372 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC13P55735 322 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZXDBP98169 803 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASSF3Q86WH2 238 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPDLQ96IR7 371 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS13Q9NVM9 706 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THADAQ6YHU6 1953 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRYQ5TBA9 3013 aa14.08□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LNP1A1A4G5 178 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf47A7E2U8 309 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7EQS6 105 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEFTY2O00292 366 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNC2P02585 160 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BDNFP23560 247 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMO2P25791 158 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANXA13P27216 316 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIK1P39086 918 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAT6P42226 847 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP46P62068 366 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAB4Q2WGN9 574 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf27AQ580R0 203 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANO7Q6IWH7 933 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PANK4Q9NVE7 773 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INVSQ9Y283 1065 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHD6Q8TD26 2715 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.07□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM66O15016 1216 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP17A1P05093 508 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP27A1Q02318 531 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SURF1Q15526 300 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCED1BQ96HM7 432 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EHD2Q9NZN4 543 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087X0B3 334 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANTXRLA6NF34 631 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF233A6NK53 670 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLFM2O95897 454 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDGFRBP09619 1106 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCP20941 246 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCKDHBP21953 392 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A9P82251 487 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RESTQ13127 1097 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRY1Q16526 586 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR49Q8IV35 697 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPQQ9Y646 472 aa14.06□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8VP50 259 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIPC1O14908 333 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROS1P07225 676 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP3CCP48454 512 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMS19Q96T76 1030 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PANK2Q9BZ23 570 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF38Q9H0F5 515 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NME7Q9Y5B8 376 aa14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PATE3B3GLJ2 98 aa14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH1A2O94788 518 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms