RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 GCNAQ96QF7 691 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 BECN2A8MW95 431 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 F11P03951 625 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 CD19P15391 556 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC25CP30307 473 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 MFAP3P55082 362 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 PARM1Q6UWI2 310 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 FGF14Q92915 247 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 CBX8Q9HC52 389 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-202ENST00000410062 CALCAP01258 141 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT5P13647 590 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SGO2Q562F6 1265 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 NUP93Q8N1F7 819 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 NUMBLQ9Y6R0 609 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ANHXE9PGG2 379 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TADA3O75528 432 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 HTR4Q13639 388 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM78AQ5JUQ0 283 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR158Q5T848 1215 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 OBSL1O75147 1896 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TNFRSF10BO14763 440 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 PAEPP09466 180 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 VDRP11473 427 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 NPR3P17342 541 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF132P52740 706 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC5A3P53794 718 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPN21Q16825 1174 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 LUZP1Q86V48 1076 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TFAP2BQ92481 460 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM81BQ96LP2 452 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 DUSP16Q9BY84 665 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 MTSS1LQ765P7 747 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ASB16Q96NS5 453 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 KXD1Q9BQD3 176 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR88Q9GZN0 384 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 EHD2Q9NZN4 543 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 LGALS16A8MUM7 142 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 DCXO43602 365 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 KLK7P49862 253 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TXNDC8Q6A555 127 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TASP1Q9H6P5 420 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 PATJQ8NI35 1801 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 HHLA1C9JL84 531 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 O00370 1275 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 YWHAQP27348 245 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 USP8P40818 1118 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TAF10Q12962 218 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC30AQ86WT1 665 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SMARCD2Q92925 531 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 FCARP24071 287 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 UBXN1Q04323 297 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TDGQ13569 410 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC44A3Q8N4M1 653 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 SHC3Q92529 594 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 NXPE3Q969Y0 559 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-202ENST00000410062 ACP6Q9NPH0 428 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms