RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 FAM200BP0CF97 657 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ACADSBP45954 432 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SLC8A3P57103 927 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 UBXN4Q92575 508 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 MYLPFQ96A32 169 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM209Q96SK2 561 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 EFCAB14O75071 495 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 EMC1Q8N766 993 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PTPRSQ13332 1948 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 F8VP50 259 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 DEFB103AP81534 67 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TSPY1Q01534 308 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SLC6A3Q01959 620 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SMOQ99835 787 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.37■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PSTPIP1O43586 416 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 AP1G2O75843 785 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 AMHP03971 560 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ACRP10323 421 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SCNN1AP37088 669 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 BCAR1P56945 870 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 RWDD2BP57060 319 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TAS2R40P59535 323 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TUBB4BP68371 445 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TEX35Q5T0J7 233 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 FUT10Q6P4F1 479 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CWH43Q9H720 699 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 USTQ9Y2C2 406 aa21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 DYNC1I1O14576 645 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 BAIAP3O94812 1187 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 FGFR3P22607 806 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PSMA2P25787 234 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PBX3P40426 434 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CDR1P51861 262 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CACNA2D1P54289 1103 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K7CLP57077 242 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TRNP1Q6NT89 227 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 IL23AQ9NPF7 189 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 LCP1P13796 627 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 FLT3P36888 993 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 C2orf54Q08AI8 447 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TAF5Q15542 800 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ELF2Q15723 593 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.35■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PATJQ8NI35 1801 aa21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 PYGMP11217 842 aa21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 KCNK16Q96T55 309 aa21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 HHLA1C9JL84 531 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 EFEMP2O95967 443 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TCF4P15884 667 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 GPD1P21695 349 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ADCY1Q08828 1119 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ADIGQ0VDE8 80 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ACAP1Q15027 740 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC38Q5VT99 294 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 AADACL2Q6P093 401 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 ARCQ7LC44 396 aa21.33■■□□□ 1.01
HDDC3-202ENST00000394272 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms