RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 GTF2A2P52657 109 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC12A3P55017 1021 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PTENP60484 403 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PHTF1Q9UMS5 762 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PPLO60437 1756 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF286BP0CG31 522 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNK16Q96T55 309 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SETD4Q9NVD3 440 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC26A2P50443 739 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MCL1Q07820 350 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MFN1Q8IWA4 741 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 DYRK4Q9NR20 520 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PYGMP11217 842 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CNGA3Q16281 694 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 LAYNQ6UX15 382 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MROH1Q8NDA8 1641 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PPATQ06203 517 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CMTM5Q96DZ9 223 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC40A1Q9NP59 571 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CDY2AQ9Y6F7 541 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CDY1Q9Y6F8 540 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0U1RQJ8 604 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ASMTLO95671 621 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 TARSP26639 723 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PDK2Q15119 407 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 DNERQ8NFT8 737 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HAS1Q92839 578 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM198AQ9UFP1 575 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRB2O60241 1585 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRF2Q8IZF7 708 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 AP4E1Q9UPM8 1137 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 LSM8O95777 96 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ODC1P11926 461 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRM3P20309 590 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FDFT1P37268 417 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HARS2P49590 506 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 BCAT1P54687 386 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CORO7P57737 925 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 TGFB2P61812 414 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIP10Q15642 601 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MEA1Q16626 185 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 NSL1Q96IY1 281 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PKP3Q9Y446 797 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SUPT3HB4E1H0 165 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ADCY3O60266 1144 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SUPT3HO75486 399 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 TGFB3P10600 412 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH8P55286 799 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ERVK-9P63128 1117 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HASPINQ8TF76 798 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 KAT5Q92993 513 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 INTS13Q9NVM9 706 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 HEY2Q9UBP5 337 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ALDH1A1P00352 501 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM153BP0C7A2 387 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM153CQ494X1 144 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR63Q9BZJ6 419 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CD274Q9NZQ7 290 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM153AQ9UHL3 310 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ANXA9O76027 345 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNMA1Q12791 1236 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX17Q15036 470 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CERS5Q8N5B7 392 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 STKLD1Q8NE28 680 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PYGLP06737 847 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 PAFAH2Q99487 392 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CPA4Q9UI42 421 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SIK3Q9Y2K2 1263 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 SDR42E2A6NKP2 422 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 VCPP55072 806 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 OPTNQ96CV9 577 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 IL1RL2Q9HB29 575 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP3A43Q9HB55 503 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms