RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 C2CD4BA6NLJ0 364 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TKTP29401 623 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 COPS2P61201 443 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 GRAP2O75791 330 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 LCP1P13796 627 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 BRCC3P46736 316 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RPL34P49207 117 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CARSP49589 748 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CUL1Q13616 776 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 HEMGNQ9BXL5 484 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ZWILCHQ9H900 591 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 HOMER3Q9NSC5 361 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 KLHL11Q9NVR0 708 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PCYOX1Q9UHG3 505 aa28.78■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 I3L4J1 428 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CLDN5O00501 218 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 NPR3P17342 541 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 COILP38432 576 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PLCB3Q01970 1234 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 HASPINQ8TF76 798 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 APBB2Q92870 758 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SLITRK1Q96PX8 696 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.77■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 M0QZQ0 153 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 ENPP3O14638 875 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 CYP11A1P05108 521 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 FAM200BP0CF97 657 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 FNTAP49354 379 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 EMBQ6PCB8 327 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 RSPH1Q8WYR4 309 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 B3GNT5Q9BYG0 378 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 LRRC19Q9H756 370 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 NFU1Q9UMS0 254 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 BRCA2P51587 3418 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 PCK1P35558 622 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 FLT3P36888 993 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SCNN1AP37088 669 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 CASP8Q14790 479 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 ABI1Q8IZP0 508 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 LRRD1A4D1F6 860 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 RRP9O43818 475 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 GABBR2O75899 941 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SDC4P31431 198 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 PIGZQ86VD9 579 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 THEM5Q8N1Q8 247 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SUSD3Q96L08 255 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 NCAPGQ9BPX3 1015 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 OGFRQ9NZT2 677 aa28.75■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 DPYSL4O14531 572 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 SASH3O75995 380 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 TJP3O95049 919 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 MIPP30301 263 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC142Q17RM4 750 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF280BQ86YH2 543 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 JAMLQ86YT9 394 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 C1orf54Q8WWF1 131 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 ACBD6Q9BR61 282 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 FAM114A2Q9NRY5 505 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 PCSK1NQ9UHG2 260 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 LRFN2Q9ULH4 789 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 USP18Q9UMW8 372 aa28.74■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 MYBPHLA2RUH7 354 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 MAP2K7O14733 419 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 DDHD2O94830 711 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 GPNMBQ14956 572 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 TAF5Q15542 800 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 TFDP3Q5H9I0 405 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 TTC27Q6P3X3 843 aa28.73■■■□□ 2.19
MSRB2-201ENST00000376510 MFSD7Q6UXD7 560 aa28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms