RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 STAT2P52630 851 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 THOP1P52888 689 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNB3P54284 484 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLRC3Q07444 240 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMU1Q2TAY7 513 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 UTS2BQ765I0 119 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 C10orf82Q8WW14 230 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SEC14L1Q92503 715 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PANX3Q96QZ0 392 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUF2Q9BZD4 464 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC188H7C350 402 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3QRK9 145 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 RIPK2O43353 540 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACSL3O95573 720 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 STRN3Q13033 797 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAMM41Q96BW9 452 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBXL8Q96CD0 374 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 GANQ9H2C0 597 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPHS2Q9NP85 383 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFT52Q9Y366 437 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 HAT1O14929 419 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPAG7O75391 227 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 BAIAP3O94812 1187 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 P4HA1P13674 534 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFITM2Q01629 132 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 GK3PQ14409 553 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TLR1Q15399 786 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLPP6Q8IY26 295 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 BORCS5Q969J3 196 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAR1AQ9NR31 198 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCINQ9Y6U3 715 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PFASO15067 1338 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 H7C0C1 242 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACSL4O60488 711 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZWINTO95229 277 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 KYNUQ16719 465 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARSHQ5FYA8 562 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 XKR5Q6UX68 686 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CROCCP2Q86T23 111 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 HACE1Q8IYU2 909 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB34Q9BZG1 259 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZBTB39O15060 712 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 AP1G1O43747 822 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 UCHL3P15374 230 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCKAP1LP55160 1127 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL9RQ01113 521 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR16Q569H4 304 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 JDP2Q8WYK2 163 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PEX13Q92968 403 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 NSL1Q96IY1 281 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNBD2Q96M20 576 aa11.25□□□□□ -0.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSRNP1Q96S65 589 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms