RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 DGKIO75912 1065 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IFNB1P01574 187 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BMP8BP34820 402 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NDST1P52848 882 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NRLP54845 237 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NUP93Q8N1F7 819 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MYLPFQ96A32 169 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SCUBE2Q9NQ36 999 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC12Q9UKB3 198 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ASB3Q9Y575 518 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CPQQ9Y646 472 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 WDR90Q96KV7 1748 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GUA9 196 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ18B7U540 433 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CBX4O00257 560 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EDIL3O43854 480 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DDHD2O94830 711 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A3P11169 496 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCB1Q12824 385 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ12Q14500 433 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 STAT4Q14765 748 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RABGAP1LQ5R372 815 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CASC4Q6P4E1 433 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DENND1CQ8IV53 801 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 LENG9Q96B70 501 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RMDN1Q96DB5 314 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PRRX2Q99811 253 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TDP1Q9NUW8 608 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TISP43B9A030 160 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGB8P26012 769 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 SEMA3FQ13275 785 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KAZNQ674X7 775 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 E2F7Q96AV8 911 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C18orf8Q96DM3 657 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TASP1Q9H6P5 420 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CDH9Q9ULB4 789 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATAD5Q96QE3 1844 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 H7C0C1 242 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TGM5O43548 720 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RARGP13631 454 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PAX3P23760 479 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PSMA2P25787 234 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ETFBP38117 255 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK9P45984 424 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5OP48047 213 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GPC5P78333 572 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 USP4Q13107 963 aa4.66□□□□□ -1.66
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