RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 BTBD6Q96KE9 485 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 SMOQ99835 787 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 CHST7Q9NS84 486 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 GJB6O95452 261 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CPB1P15086 417 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RASIP1Q5U651 963 aa21.83■■□□□ 1.08
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PACSIN3-201ENST00000298838 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM7Q9C029 511 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 STK39Q9UEW8 545 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 AMFRQ9UKV5 643 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D4O60343 1298 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNA2D1P54289 1103 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMD5Q16401 504 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNK16Q96T55 309 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 TLR10Q9BXR5 811 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCB6Q9NP58 842 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MTRRQ9UBK8 725 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ALG6Q9Y672 507 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 NCK2O43639 380 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GABBR2O75899 941 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 LCP1P13796 627 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GLUD2P49448 558 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ADIGQ0VDE8 80 aa21.81■■□□□ 1.08
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PACSIN3-201ENST00000298838 PTPROQ16827 1216 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.81■■□□□ 1.08
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PACSIN3-201ENST00000298838 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PATJQ8NI35 1801 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00271P0C7V0 271 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 ARPP19P56211 112 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC6A3Q01959 620 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 DSG1Q02413 1049 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT17Q04695 432 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR17Q13304 367 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SNX12Q9UMY4 172 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PROSCO94903 275 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 URODP06132 367 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 COMTP21964 271 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SCNN1AP37088 669 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC1A1P43005 524 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 AMPD2Q01433 879 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS6KA1Q15418 735 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 C2CD2LO14523 706 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 SPOPO43791 374 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 FGF18O76093 207 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2F1P24903 491 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIK1P39086 918 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 VSTM1Q6UX27 236 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS52Q8N1B4 723 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-201ENST00000298838 HES6Q96HZ4 224 aa21.79■■□□□ 1.08
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