RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 FERP16591 822 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PDE6CP51160 858 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 EPHA5P54756 1037 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZBED6P86452 979 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF677Q86XU0 584 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 LEMD2Q8NC56 503 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MYRFLQ96LU7 910 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC3Q9BY71 257 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 UBXN6Q9BZV1 441 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 AIPL1Q9NZN9 384 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 COL6A3P12111 3177 aa14□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SLC38A8A6NNN8 435 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 M0QYV0 167 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF10BO14763 440 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MBTPS2O43462 519 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC172P0C7W6 258 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PTPN2P17706 415 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MTHFRP42898 656 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PLA2G4AP47712 749 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MAP3K7CLP57077 242 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SLC8A3P57103 927 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PDE4CQ08493 712 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ARID5BQ14865 1188 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ATAT1Q5SQI0 421 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TMC8Q8IU68 726 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NUP93Q8N1F7 819 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GIPC2Q8TF65 315 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35F5Q8WV83 523 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 RIPOR3Q96MK2 946 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TTLL2Q9BWV7 592 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 APOL5Q9BWW9 433 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PIDD1Q9HB75 910 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 COMMD8Q9NX08 183 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 IL37Q9NZH6 218 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 EHD2Q9NZN4 543 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 THEGQ9P2T0 379 aa13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 FAM92AA1XBS5 289 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 RHOP08100 348 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CASP14P31944 242 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCIP41743 596 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GPD2P43304 727 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SLC5A3P53794 718 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CLUL1Q15846 466 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 RAB41Q5JT25 222 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PIGZQ86VD9 579 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 UBA3Q8TBC4 463 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GPR152Q8TDT2 470 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 LHX5Q9H2C1 402 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ASAH2Q9NR71 780 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CDH22Q9UJ99 828 aa13.98□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TULP2O00295 520 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CFHP08603 1231 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CDC25BP30305 580 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 KRT9P35527 623 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 USP46P62068 366 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CDR2Q01850 454 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MTMR3Q13615 1198 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TAF12Q16514 161 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ASIC2Q16515 512 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS36Q5K4E3 855 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DENND1BQ6P3S1 775 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms