RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 C7orf26Q96N11 449 aa22.17■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.17■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 SLC18A2Q05940 514 aa22.17■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 DAW1Q8N136 415 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 CNBD2Q96M20 576 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.16■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 MYBPC1Q00872 1141 aa22.15■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 E2F7Q96AV8 911 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 NGLY1Q96IV0 654 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.15■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 H3BNX3 289 aa22.15■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 COPEO14579 308 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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ODC1-201ENST00000234111 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 CPT1BQ92523 772 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 JADE3Q92613 823 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 CDH22Q9UJ99 828 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 PROCP04070 461 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 ALDH1A3P47895 512 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 ANO5Q75V66 913 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 ZNF410Q86VK4 478 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 POMPQ9Y244 141 aa22.14■■□□□ 1.14
ODC1-201ENST00000234111 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 87.1
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ODC1-201ENST00000234111 PEX1O43933 1283 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.131e-323■■■■■ 34.4
ODC1-201ENST00000234111 KRT1P04264 644 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 CD48P09326 243 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 AOC1P19801 751 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 HPS6Q86YV9 775 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 NT5C1BQ96P26 610 aa22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ODC1-201ENST00000234111 RAB20Q9NX57 234 aa22.14■■□□□ 1.13
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