RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Actl9Q8CG27 415 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpv6Q91WD2 767 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhb2Q91Y00 799 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mettl13Q91YR5 698 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trps1Q925H1 1281 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CalcbQ99MP3 130 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cuedc2Q9CXX9 284 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mms19Q9D071 1031 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn9Q9D805 690 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rexo2Q9D8S4 237 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anapc7Q9WVM3 565 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapk13Q9Z1B7 366 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arid2E9Q7E2 1828 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf804aA2AKY4 1200 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7995L7N2E4 160 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il27raO70394 623 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CopeO89079 308 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HpdP49429 393 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sox1P53783 391 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RalaP63321 206 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Msx3P70354 204 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zscan2Q07230 614 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndst1Q3UHN9 882 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nlrc4Q3UP24 1024 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syne3Q4FZC9 975 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gas6Q61592 674 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Has1Q61647 583 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nr2e1Q64104 385 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atl2Q6PA06 583 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr389Q7TRX7 312 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim62Q80V85 475 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slitrk1Q810C1 696 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SowahaQ8BLS7 548 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem260Q8BMD6 703 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lig4Q8BTF7 911 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgef33Q8BW86 850 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kctd12bQ8C7J6 292 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Agbl2Q8CDK2 862 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kat14Q8CID0 779 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adgrg3Q8R0T6 542 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Timd2Q8R183 305 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rem2Q8VEL9 341 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Epn3Q91W69 636 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alg1Q921Q3 482 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col25a1Q99MQ5 666 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trem2Q99NH8 227 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zmat2Q9CPW7 199 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mis12Q9CY25 206 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc71Q9D3W5 558 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dusp21Q9D9D8 189 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spata9Q9D9R3 252 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MefvQ9JJ26 767 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cbx8Q9QXV1 362 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnni1Q9WUZ5 187 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm28510A0A087WP28 240 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm12394A2AKP6 982 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc170D3YXL0 722 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lipo2D3YY49 398 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3252E9PUT9 216 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gimd1E9PW74 217 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5926E9PWJ8 236 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 E9Q0B3 247 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3468E9QAJ8 216 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LctF8VPT3 1931 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mroh4G3X8W1 983 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TpteG5E8H5 664 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptpn9O35239 593 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Art2aP17981 287 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cav1P49817 178 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnn2P58390 839 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnq1P97414 668 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mark3Q03141 753 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bpifb5Q3UQ05 490 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EfsQ64355 560 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr156Q6PCP7 798 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr151Q7TSN6 422 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxo2Q80UW2 297 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcp10aQ80W76 438 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r43Q80Z08 845 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd45Q810N6 248 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dupd1Q8BK84 215 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rassf9Q8K342 435 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smg8Q8VE18 991 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snrnp25Q8VIK1 123 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Senp2Q91ZX6 588 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cntnap4Q99P47 1310 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ogfod2Q9CQ04 349 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.1 ms