RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nrbp2Q91V36 499 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ier5lQ99J55 406 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmd9Q9CR00 222 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mms19Q9D071 1031 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PapolbQ9WVP6 641 aa16.75■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam171a2A2A699 822 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NumblO08919 604 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arid5aQ3U108 590 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Azin2Q8BVM4 459 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudcd3Q8R1N4 363 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim60Q8VI40 466 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tsc1Q9EP53 1161 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ly6iQ9WU67 134 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Birc5O70201 140 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neurog2P70447 263 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VcpQ01853 806 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp3a16Q64481 504 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CbarpQ66L44 698 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exd1Q8CDF7 570 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kat14Q8CID0 779 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbed6D2EAC2 980 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 E2f6O54917 272 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aoc3O70423 765 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkchP23298 683 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gjb1P28230 283 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scarf2P59222 833 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GmpsQ3THK7 693 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd180Q62192 661 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capn11Q6J756 714 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ahcyl1Q80SW1 530 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem74Q8BQU7 305 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C8aQ8K182 587 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rassf3Q99P51 232 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim42Q9D2H5 723 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcg8Q9DBM0 673 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ambra1A2AH22 1300 aa16.74■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssxb9A2BI93 185 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cetn1P41209 172 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab6bP61294 208 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magea3Q6T340 320 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2t4E9PWV0 503 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrf2E9Q4J9 644 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcpt4P21812 246 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc1a2P43006 572 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klf1P46099 358 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Frg1P97376 258 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prmt9Q3U3W5 846 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf12Q61286 706 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc68Q8BVC4 333 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snrnp27Q8K194 155 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr449Q8VGW8 311 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpv6Q91WD2 767 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tssk3Q9D2E1 268 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pck1Q9Z2V4 622 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9b2Q5BKR2 547 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab34Q64008 259 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdtc1Q80ZK9 677 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r199Q8R280 367 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alg9Q8VDI9 611 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cul3Q9JLV5 768 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn4Q9WU22 926 aa16.73■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh2d4bA6X942 431 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn20O55082 426 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgfr2P21803 821 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plk1Q07832 603 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acot5Q6Q2Z6 421 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt15Q8C6N3 418 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt5Q922U2 580 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PorcnQ9JJJ7 461 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gcnt4E9Q649 455 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptp4a2O70274 167 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Frmd5Q6P5H6 517 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnk18Q6VV64 394 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam102aQ78T81 392 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r43Q80Z08 845 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nat14Q8BVG8 206 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ParvaQ9EPC1 372 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.3 ms