RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		-0.53	□□□□□ -2.49
snR46	snR46	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YKL162C	P36052	402 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	DOG2	P38773	246 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	DOG1	P38774	246 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YAR029W	P39549	74 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	IMP2	P46972	177 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	DOC1	P53068	250 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	VOA1	P53262	265 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PDR17	P53844	350 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YDR366C	P87287	132 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	ABF2	Q02486	183 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	NHP10	Q03435	203 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YDR248C	Q03786	193 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RUB1	Q03919	77 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	COX20	Q04935	205 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	SYM1	Q06563	197 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	IRC19	Q07843	230 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YOR385W	Q08909	290 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PAU17	Q12370	124 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RDI1	Q12434	202 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	COA3	Q3E7B2	85 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		-0.54	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	ATP6	P00854	259 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YBL039W-B	P0C268	59 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	AQY2	P0CD90	149 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	URA6	P15700	204 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	MER1	P16523	270 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	TRX3	P25372	127 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	HSP30	P25619	332 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	UBC8	P28263	218 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	MRP49	P32388	137 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RPC25	P35718	212 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	CAF4	P36130	643 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	MRPL28	P36527	147 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	COS8	P38723	381 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	NVJ1	P38881	321 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YIL102C	P40488	101 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YRB2	P40517	327 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	-0.55	□□□□□ -2.5	not detected
snR46	snR46	ICS3	P47034	131 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YGR050C	P53231	118 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PGA1	P53896	198 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YNL146W	P53906	100 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	CWC27	Q02770	301 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	NCE101	Q02820	53 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	MAK3	Q03503	176 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PLP1	Q04004	230 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	BNA7	Q04066	261 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	SML1	Q04964	104 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	ATP17	Q06405	101 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YPD1	Q07688	167 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	GET4	Q12125	312 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	FYV7	Q12247	151 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	MDY2	Q12285	212 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	MHF2	Q3E829	80 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		-0.55	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	QCR2	P07257	368 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PAU1	P0CE88	120 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PAU14	P0CE89	120 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YUH1	P35127	236 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RRT1	P38192	103 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	UMP1	P38293	148 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YBR209W	P38311	105 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	ERV15	P38312	142 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	AME1	P38313	324 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	YEA6	P39953	335 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	GTT1	P40582	234 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	OST2	P46964	130 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	PAC10	P48363	199 aa		-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	-0.56	□□□□□ -2.5
snR46	snR46	RMR1	P53060	241 aa		-0.56	□□□□□ -2.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.8 ms