RNA–Protein interactions for RNA: YLR057W

MNL2, Transcript of Putative mannosidase involved in ER-associated protein degradation, yeast

Gene MNL2, Length 2,550 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL2	YLR057W	YHL042W	P38729	150 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YEL028W	P39989	153 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	XPT1	P47165	209 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YGL235W	P53071	178 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	TIM8	P57744	87 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	GPI11	Q06636	219 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ATG41	Q12048	136 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SPO14	P36126	1683 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	QCR2	P07257	368 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MRP17	P28778	131 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SFK1	P35735	353 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MOB1	P40484	314 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAM16	P42949	149 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	CNL1	Q06333	122 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SYM1	Q06563	197 aa		0.95	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RIF1	P29539	1916 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	VAR1	P02381	398 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	DER1	P38307	211 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YHR130C	P38834	111 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YEL073C	P39974	107 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PIR1	Q03178	341 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	DNF3	Q12674	1656 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	FIP1	P45976	327 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SBH2	P52871	88 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ELC1	Q03071	99 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	TMA23	Q03525	211 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.94	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	UBR2	Q07963	1872 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAI3	P01094	68 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	INO4	P13902	151 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MAK31	P23059	88 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YCL042W	P25572	119 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YEA6	P39953	335 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	EMC5	P40540	141 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RCE1	Q03530	315 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	COA6	Q3E846	104 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YCR099C	P25657	155 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.93	□□□□□ -2.26	not detected
MNL2	YLR057W	YNL198C	P40166	100 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YJR015W	P47090	510 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	EST3	Q03096	181 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	AVO2	Q04749	426 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	HUT1	Q12520	339 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.93	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	ANB1	P19211	157 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MRS4	P23500	304 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YEL067C	P39978	195 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	SWM2	P40342	146 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAU15	P40585	124 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YGR039W	P53225	103 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	APS2	Q00381	147 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	FIT1	Q04433	528 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YPR114W	Q06107	315 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	KEI1	Q06346	221 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RRT7	Q07829	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAU23	Q07987	124 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAU17	Q12370	124 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	NUM1	Q00402	2748 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MRP49	P32388	137 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	HHT1	P61830	136 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PRM3	Q08931	133 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	MOT1	P32333	1867 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	APC1	P53886	1748 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RAD6	P06104	172 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MNL2	YLR057W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26

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