RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	RRT13	P40042	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRP4	YHR069C	BRP1	P53194	125 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRP4	YHR069C	SCW10	Q04951	389 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRP4	YHR069C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRP4	YHR069C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRP4	YHR069C	Q0255	P03881	472 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	SDS23	P53172	527 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YGR017W	P53210	297 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	DIA1	P54005	336 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	CSM4	Q08955	156 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
RRP4	YHR069C	SDH8	P38345	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YHR140W	P38842	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	PAU7	P39545	55 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	IRC22	P40006	225 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	KEG1	P43614	200 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YDR366C	P87287	132 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	GPI19	Q04082	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	ZRT1	P32804	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YKR032W	P36127	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	SUR2	P38992	349 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	GTO3	Q04806	366 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YCR001W	P25347	104 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	PET8	P38921	284 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YGR149W	P48236	432 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	CYT2	Q00873	224 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	AIM34	Q03673	198 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	VAM10	Q08474	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	POM33	Q12164	279 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YCR023C	P25351	611 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YCH1	P42937	148 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YPS5	P53057	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	ARL3	Q02804	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	DXO1	Q06349	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRP4	YHR069C	MRPL28	P36527	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	KRE9	P39005	276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	ELF1	P36053	145 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YNL217W	P40152	326 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	SGF11	Q03067	99 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	TVP18	Q04767	167 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	ATP16	Q12165	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	ATP23	P53722	227 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	HAL1	Q01766	294 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	MGR2	Q02889	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	SAL1	D6W196	494 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YER134C	P40081	178 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	PFY1	P07274	126 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	UBC5	P15732	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YER076C	P40049	302 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	DCV1	P43595	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	DGA1	Q08650	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YPT53	P36019	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	TEM1	P38987	245 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YJL028W	P47062	111 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YGL118C	P53132	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	SSS1	P35179	80 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	OST3	P48439	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	GLO1	P50107	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	SEN15	Q04675	128 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	CRC1	Q12289	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRP4	YHR069C	TOS6	P48560	102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRP4	YHR069C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRP4	YHR069C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRP4	YHR069C	CDC43	P18898	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRP4	YHR069C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RRP4	YHR069C	RPR2	P40571	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRP4	YHR069C	YJR146W	P47174	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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