RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	UBC4	P15731	148 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	BET1	P22804	142 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	SPO13	P23624	291 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	MED6	P38782	295 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	BXI1	P48558	297 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	TIM18	Q08749	192 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RIM4	YHL024W	YHL042W	P38729	150 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	RRT13	P40042	185 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	VPS55	P47111	140 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	TDA4	P47153	279 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	LPP1	Q04396	274 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YOR105W	Q08504	108 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MIC10	Q96VH5	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SFT2	P38166	215 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YER181C	P40097	107 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	CIS3	P47001	227 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YGL034C	P53186	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YNL046W	P53956	172 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MIM1	Q08176	113 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	NUM1	Q00402	2748 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MDH2	P22133	377 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MXR2	P25566	168 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	FZF1	P32805	299 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YBL059W	P34224	193 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	GGC1	P38988	300 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	TIM17	P39515	158 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	PIR1	Q03178	341 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SYM1	Q06563	197 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MIX17	Q03667	156 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YFL019C	P43576	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	PIR5	P46999	287 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	TPC1	P53257	314 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	COX12	Q01519	83 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	EMC6	Q12431	108 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YGL118C	P53132	145 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	RNH203	Q12338	110 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	AHT1	P29589	182 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YNL217W	P40152	326 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YCR025C	P25352	136 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SWD3	P38123	315 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	PEX17	P40155	199 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	BRP1	P53194	125 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	HAL1	Q01766	294 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	COA2	Q3E823	68 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YPR117W	Q06116	2489 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	FPR2	P32472	135 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	DSE2	P38844	325 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	Q0255	P03881	472 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	IMP1	P28627	190 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	TIM12	P32830	109 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	TVP23	P38962	199 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RIM4	YHL024W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	CCH1	P50077	2039 aa		3.03	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YCR022C	P25620	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	KEG1	P43614	200 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	NRM1	P53718	249 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YIL163C	P40448	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YFR035C	P43608	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	CRH1	P53301	507 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	APS1	P35181	156 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YER187W	P40102	141 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RIM4	YHL024W	YDR102C	Q03864	110 aa		3.01	□□□□□ -1.93

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