RNA–Protein interactions for RNA: YGR065C

VHT1, Transcript of High-affinity plasma membrane H+-biotin (vitamin H) symporter, yeast

Gene VHT1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHT1	YGR065C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VHT1	YGR065C	YEL067C	P39978	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	ROX3	P25046	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	FPR2	P32472	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	EMC6	Q12431	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YER187W	P40102	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YNR077C	P53758	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	SWD3	P38123	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PCL5	P38794	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	TIM17	P39515	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YFL051C	P43552	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	SIM1	P40472	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YGR050C	P53231	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	SWS2	P53937	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	IRC23	Q08416	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PAU7	P39545	55 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YIA6	P40556	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	GAT4	P40569	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PET191	Q02772	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	MIX14	Q04341	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YHR180W	P38868	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YNL217W	P40152	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YNL046W	P53956	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YSY6	P38374	65 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YHR173C	P38864	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PET8	P38921	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	YFL019C	P43576	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PIR1	Q03178	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PCL2	P25693	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	HUA1	P40325	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	CUZ1	P53899	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	API2	Q04413	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VHT1	YGR065C	PFY1	P07274	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	GLO1	P50107	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	MED6	P38782	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	PIR5	P46999	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	EAF6	P47128	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	UBC13	P52490	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	DSS4	P32601	143 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	NRM1	P53718	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YNL234W	P53857	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	TIM22	Q12328	207 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	MXR2	P25566	168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
VHT1	YGR065C	ATP23	P53722	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	DIF1	O13577	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YKR032W	P36127	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	AIM19	P40502	157 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	NCA3	P46955	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	TOM7	P53507	60 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	PBA1	Q05778	276 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YBR209W	P38311	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	PEX17	P40155	199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	VHS2	P40463	436 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	YOR268C	Q08734	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	HNT2	P49775	206 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VHT1	YGR065C	ICY1	Q04329	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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