RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C HNT2P49775 206 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C ROT1Q03691 256 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RXT3Q07458 294 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YLR112WQ12130 139 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YOR343CQ12484 108 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C Q0182Q9ZZW1 134 aa2.85□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C UBC4P15731 148 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C TOM40P23644 387 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YEL067CP39978 195 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RRT13P40042 185 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C NCA3P46955 337 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C UBC13P52490 153 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YGR219WP53307 113 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YNR077CP53758 84 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YDR102CQ03864 110 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MIX14Q04341 121 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C YMR320WQ04897 101 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C HNT3Q08702 217 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C FIT2Q08906 153 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C IGO2Q9P305 131 aa2.84□□□□□ -1.95
SPT4YGR063C MDM35O60200 86 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C MRS3P10566 314 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C REC104P33323 182 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C PET8P38921 284 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data2.83□□□□□ -1.96not detected
SPT4YGR063C AIM19P40502 157 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C OST1P41543 476 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C NCE101Q02820 53 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C IRC23Q08416 157 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YGL258W-AQ3E740 77 aa2.83□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C PCL2P25693 308 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C IES6P32617 166 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C SWD3P38123 315 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YSY6P38374 65 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C CTR2P38865 189 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C SIM1P40472 476 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YIA6P40556 373 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YFL051CP43552 160 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C TOS6P48560 102 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C VEL1P53058 206 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C IRC19Q07843 230 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YOR387CQ08910 206 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C TIM22Q12328 207 aa2.82□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C PFY1P07274 126 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C DSE2P38844 325 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C MBB1P39534 108 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C HAL1Q01766 294 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YMR254CQ04838 102 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YPL261CQ08976 102 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C EMC6Q12431 108 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C COA3Q3E7B2 85 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YPR053CQ6Q5F3 151 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C CCW14O13547 238 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C BET1P22804 142 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C LDB16P25587 256 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YKR032WP36127 104 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C PEX22P39718 180 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C SPI1P40092 148 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C TOM7P53507 60 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YLR194CQ05777 254 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YLR281CQ05863 155 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YOL118CQ08259 102 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C VPS68Q12016 184 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YDL022C-AP0C5L6 82 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YHR213WP0CI67 198 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C MTC6P38849 526 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YAR029WP39549 74 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YER187WP40102 141 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C SWS2P53937 143 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C MOT3P54785 490 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C GAT3Q07928 141 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C PPT2Q12036 173 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YDL009CQ12210 107 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YLR111WQ12528 110 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C HMRA2P0CY13 119 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C MSA2P36157 363 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C MPC2P38857 129 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
SPT4YGR063C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YDR209CQ03480 137 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YHP1Q04116 353 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YOR192C-CQ3E736 78 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C YLR342W-AQ3E810 57 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT4YGR063C AGA1P32323 725 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT4YGR063C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT4YGR063C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97not detected
SPT4YGR063C YHR022CP38763 256 aa2.77□□□□□ -1.97
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