RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C MOG1P47123 218 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DAN1P47178 298 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C APS2Q00381 147 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C COX12Q01519 83 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C GIM5Q04493 163 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C ZEO1Q08245 113 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YPR063CQ12160 140 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YOP1Q12402 180 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YOL085CQ99345 113 aa1.63□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C VAR1P02381 398 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C Q0255P03881 472 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C HMRA1P0CY11 126 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C CUP2P15315 225 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C AUA1P32450 94 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAM17P36147 197 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DAD2P36162 133 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C NRG2P38082 220 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MIX23P38162 196 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YBR013CP38215 129 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPB11P38902 120 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C NSE4P43124 402 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU5P43575 122 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C COX16P47081 118 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YGR017WP53210 297 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YGR026WP53217 278 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C HAL1Q01766 294 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C UPS3Q04006 179 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C TIM22Q12328 207 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YNR034W-AQ3E841 98 aa1.62□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU19P0CE85 124 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU21P0CE86 164 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU22P0CE87 164 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCR001WP25347 104 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU3P25610 124 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data1.61□□□□□ -2.15not detected
GCN4YEL009C YHR140WP38842 239 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C PAU7P39545 55 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C IRC22P40006 225 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C GTT1P40582 234 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C KEG1P43614 200 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SDS23P53172 527 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C THG1P53215 237 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DIA1P54005 336 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YML108WQ03759 105 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C GPI19Q04082 140 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C GTO3Q04806 366 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C CSM4Q08955 156 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C POM33Q12164 279 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YBR200W-AQ3E755 54 aa1.61□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C ZRT1P32804 376 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SUR2P38992 349 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RRT13P40042 185 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C VHS2P40463 436 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C BRP1P53194 125 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YDR366CP87287 132 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C DXO1Q06349 442 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C FSF1Q12029 327 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCR075W-AQ3E830 75 aa1.6□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C POR1P04840 283 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SEC4P07560 215 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C MRPL28P36527 147 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YNL217WP40152 326 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCH1P42937 148 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YGR149WP48236 432 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YPS5P53057 165 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C CYT2Q00873 224 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C SGF11Q03067 99 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C AIM34Q03673 198 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C TVP18Q04767 167 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YLR042CQ07990 161 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C VAM10Q08474 114 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C WIP1Q2V2P8 89 aa1.59□□□□□ -2.15
GCN4YEL009C YCR023CP25351 611 aa1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C KTI12P34253 313 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YKR032WP36127 104 aa1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C PET8P38921 284 aa1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C TEM1P38987 245 aa1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C ARL3Q02804 198 aa1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YGR240C-AQ3E786 66 aa1.58□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C SAL1D6W196 494 aa1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C SEC72P39742 193 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YER076CP40049 302 aa1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YER134CP40081 178 aa1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C DCV1P43595 202 aa1.57□□□□□ -2.16
GCN4YEL009C PMP3P87284 55 aa1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms