RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	YPR114W	Q06107	315 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	HUT1	Q12520	339 aa		0.63	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	EST3	Q03096	181 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	FIT1	Q04433	528 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YMR320W	Q04897	101 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	RAF1	Q06891	181 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	FCY1	Q12178	158 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	NMT1	P14743	455 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SRL3	P36167	246 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YEL014C	P39999	101 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	MPM1	P40364	252 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	PHB1	P40961	287 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YGR201C	P42936	225 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YGR042W	P53227	271 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.62	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	EMC4	P53073	190 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	RFU1	Q08003	200 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SPC3	Q12133	184 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	VAR1	P02381	398 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	ETR1	P38071	380 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SPC2	Q04969	178 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	INO4	P13902	151 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SPT14	P32363	452 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	MRPL15	P36523	253 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YAR064W	P39563	99 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YIL102C	P40488	101 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	TIM8	P57744	87 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	IRC19	Q07843	230 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	RIB3	Q99258	208 aa		0.61	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	KIN28	P06242	306 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	MRS4	P23500	304 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	CYC2	P38909	366 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YEL008W	P40001	126 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YFL065C	P43539	102 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YFL051C	P43552	160 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	MRPL44	P19956	98 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	GLC8	P41818	229 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	DCV1	P43595	202 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SWC7	Q06707	132 aa		0.6	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	UGX2	P32772	223 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YBR242W	P38331	238 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	DIE2	P50076	525 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	CSN9	Q03981	162 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SPC24	Q04477	213 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	LAA1	P39526	2014 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	HFA1	P32874	2273 aa		0.59	□□□□□ -2.31
APL3	YBL037W	HYM1	P32464	399 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	HSP150	P32478	413 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	AIM19	P40502	157 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YJL009W	P47078	108 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YGL230C	P53074	147 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YNL019C	P53975	284 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	NHP10	Q03435	203 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	AVO2	Q04749	426 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	UBR1	P19812	1950 aa		0.59	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	ANB1	P19211	157 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	SED1	Q01589	338 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	IRC21	Q04772	201 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	IPT1	P38954	527 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	HUA1	P40325	198 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	GPI11	Q06636	219 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	NAT5	Q08689	176 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YGR017W	P53210	297 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.58	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YBR027C	P38220	110 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YHL037C	P38733	133 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YHR140W	P38842	239 aa		0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
APL3	YBL037W	SOM1	Q05676	74 aa		0.57	□□□□□ -2.32

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