RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ATG13O75143 517 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 F11P03951 625 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CSH1P0DML2 217 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CSH2P0DML3 217 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PCSK1P29120 753 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 MYO1EQ12965 1108 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PKP1Q13835 747 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TAF12Q16514 161 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 STPG1Q5TH74 334 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 SLC46A2Q9BY10 475 aa23.62■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TNNC2P02585 160 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 HOXC13P31276 330 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 GPR15P49685 360 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CCDC6Q16204 474 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PLA2G2CQ5R387 149 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 KBTBD6Q86V97 674 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 HPDLQ96IR7 371 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 MYRFLQ96LU7 910 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 RXFP3Q9NSD7 469 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 SLC8A2Q9UPR5 921 aa23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 HELZP42694 1942 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TADA3O75528 432 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 NOL4O94818 638 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 MPLP40238 635 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 ME1P48163 572 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CCDC142Q17RM4 750 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TMEM196Q5HYL7 178 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 FAM171BQ6P995 826 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.6■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CHD6Q8TD26 2715 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 HCRTO43612 131 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CYP2F1P24903 491 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CASP1P29466 404 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 MAGEA11P43364 429 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CYP24A1Q07973 514 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PSMD6Q15008 389 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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SRRT-218ENST00000620394 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CAMKK1Q8N5S9 505 aa23.59■■□□□ 1.37
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SRRT-218ENST00000620394 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CGRRF1Q99675 332 aa23.59■■□□□ 1.37
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SRRT-218ENST00000620394 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 VPS45Q9NRW7 570 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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SRRT-218ENST00000620394 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.59■■□□□ 1.37
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SRRT-218ENST00000620394 SDK1Q7Z5N4 2213 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.59■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 KCNK5O95279 499 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 PXNP49023 591 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 SYT15Q9BQS2 421 aa23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SRRT-218ENST00000620394 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 AVPR1AP37288 418 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CUL4BQ13620 913 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 DDR2Q16832 855 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MON1AQ86VX9 555 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CDH9Q9ULB4 789 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CCL26Q9Y258 94 aa23.57■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 CLIC2O15247 247 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-218ENST00000620394 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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