RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP4Q13107 963 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSRP2Q16527 193 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR49Q8IV35 697 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC16Q8NEE8 873 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 DHX58Q96C10 678 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDH9Q9ULB4 789 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 C2orf78A6NCI8 922 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP6R2O75170 966 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L7P0C7H9 530 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 GJA4P35212 333 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 GALK1P51570 392 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 AMPD2Q01433 879 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 NETO1Q8TDF5 533 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CUEDC2Q9H467 287 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ECT2Q9H8V3 914 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATG13O75143 517 aa22.22■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 BDNFP23560 247 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SHC4Q6S5L8 630 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CPA6Q8N4T0 437 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSIP1Q8NA03 581 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 RDH13Q8NBN7 331 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 TGFB1I1O43294 461 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DRD1P21728 446 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 IFNAR2P48551 515 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 AMPD3Q01432 767 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP27A1Q02318 531 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 VSTM1Q6UX27 236 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-208ENST00000616074 MMS19Q96T76 1030 aa22.21■■□□□ 1.15
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CLIC2O15247 247 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDF9O60383 454 aa22.2■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNB1Q14721 858 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 BACH2Q9BYV9 841 aa22.2■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 HHIPQ96QV1 700 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 CGRRF1Q99675 332 aa22.19■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBE4BO95155 1302 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 AXIN1O15169 862 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC192P0DO97 292 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANXA13P27216 316 aa22.18■■□□□ 1.14
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