RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT13	Q7L8C5	426 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CD101	Q93033	1021 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ACCS	Q96QU6	501 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM206	Q9H813	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	APBB3	O95704	486 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT19	P08727	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	USP17L7	P0C7H9	530 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GAP43	P17677	238 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GART	P22102	1010 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNAR2	P48551	515 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	USP46	P62068	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	AMPD2	Q01433	879 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO43	Q4G163	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP2A3	Q93084	1043 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MYLPF	Q96A32	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK5	O95279	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	IDE	P14735	1019 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LMO2	P25791	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	OPRD1	P41143	372 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SHC2	P98077	582 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CREB5	Q02930	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD2	Q13200	908 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM171B	Q6P995	826 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ACD	Q96AP0	544 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT15	Q9BQS2	421 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	EDEM2	Q9BV94	578 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	EBF1	Q9UH73	591 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	INVS	Q9Y283	1065 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	NME7	Q9Y5B8	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LNP1	A1A4G5	178 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF3	P15923	654 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	BCKDHB	P21953	392 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PCSK1	P29120	753 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA11	P43364	429 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	LHX1	P48742	406 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC13	P55735	322 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	RBP5	P82980	135 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	REST	Q13127	1097 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNB1	Q14721	858 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	ELF2	Q15723	593 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	HPS3	Q969F9	1004 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms