RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 M0QZQ0 153 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PDXKO00764 312 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 ABLIM1O14639 778 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TNK2Q07912 1038 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RUNX3Q13761 415 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NFIL3Q16649 462 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 WDR44Q5JSH3 913 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FOXR2Q6PJQ5 311 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TCEAL3Q969E4 200 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 EBF1Q9UH73 591 aa13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 A0A0B4J269 797 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LNP1A1A4G5 178 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RNF40O75150 1001 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CLTAP09496 248 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DPP6P42658 865 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LRRC63Q05C16 580 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LMAN2Q12907 356 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CENPPQ6IPU0 288 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SLC39A4Q6P5W5 647 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GAREM2Q75VX8 874 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SYT13Q7L8C5 426 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MLKLQ8NB16 471 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GLIS3Q8NEA6 775 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM174Q8WUU8 243 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 HHIPQ96QV1 700 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GKN1Q9NS71 199 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FRYQ5TBA9 3013 aa13.88□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GIPC1O14908 333 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PRAMEF12O95522 483 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 ODC1P11926 461 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TYMPP19971 482 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CYP3A5P20815 502 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RPL13P26373 211 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LRPAP1P30533 357 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PPP2R3AQ06190 1150 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SMARCB1Q12824 385 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PDGFRLQ15198 375 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 STX1AQ16623 288 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SLC9A9Q8IVB4 645 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CD302Q8IX05 232 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GPD1LQ8N335 351 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 GATA6Q92908 595 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.87□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MTMR11A4FU01 709 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 H0Y626 953 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 BIN1O00499 593 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 IL18RAPO95256 599 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TRIM16O95361 564 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 OR4Q2P0C623 313 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DGKEP52429 567 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NLRP12P59046 1061 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RING1Q06587 406 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 KCNA1Q09470 495 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PAK1Q13153 545 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DMC1Q14565 340 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SURF1Q15526 300 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NFKBIBQ15653 356 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.86□□□□□ -0.19
FCHO1-225ENST00000598539 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms