RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589054.5

NEDD4L-225, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NEDD4L, Length 1,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-225ENST00000589054 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.251e-7■■■□□ 17
NEDD4L-225ENST00000589054 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 SOBPA7XYQ1 873 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 YEATS4O95619 227 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 TNNC2P02585 160 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 RETP07949 1114 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 HOXA6P31267 233 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 GJA4P35212 333 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 MAGEA11P43364 429 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 CYP2J2P51589 502 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 USP4Q13107 963 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 PKP1Q13835 747 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 MTF1Q14872 753 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 TTC16Q8NEE8 873 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 CUEDC2Q9H467 287 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 CDH9Q9ULB4 789 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-225ENST00000589054 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CYP24A1Q07973 514 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 MYO1EQ12965 1108 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CUL4BQ13620 913 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 IQUBQ8NA54 791 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 PCED1BQ96HM7 432 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 ECT2Q9H8V3 914 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 RAB23Q9ULC3 237 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 GDF9O60383 454 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 RNF40O75150 1001 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CASP4P49662 377 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 LMNB2Q03252 620 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 PSMD6Q15008 389 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SURF1Q15526 300 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 EML3Q32P44 896 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 UNC13DQ70J99 1090 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SNX21Q969T3 373 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SPATA17Q96L03 361 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 MMS19Q96T76 1030 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CGRRF1Q99675 332 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 USP17L7P0C7H9 530 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 ARHGAP8P85298 464 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.247e-12■■■□□ 16.7
NEDD4L-225ENST00000589054 PDGFRLQ15198 375 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 GAB4Q2WGN9 574 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 RNF38Q9H0F5 515 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CKMP06732 381 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 HDCP19113 662 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 TNNI1P19237 187 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CNR2P34972 360 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 GRIK1P39086 918 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 AFMP43652 599 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 MYL6P60660 151 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 AMPD3Q01432 767 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CYP27A1Q02318 531 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 VSTM1Q6UX27 236 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 F8VP50 259 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CLDN5O00501 218 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 KLRC4O43908 158 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 TACC1O75410 805 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 F13A1P00488 732 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 CCDC6Q16204 474 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD4L-225ENST00000589054 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.78■■□□□ 1.24
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