RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574407.5

PHF23-210, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene PHF23, Length 497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-210ENST00000574407 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 TSSK4Q6SA08 328 aa22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MSANTD3Q96H12 275 aa22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 A0A1W2PQ27 194 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 A0A1W2PQ64 194 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 A0A1W2PQD8 194 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 PDXKO00764 312 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 CHRNB1P11230 501 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 DLG4P78352 724 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 DPYDQ12882 1025 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 BIRC3Q13489 604 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MON1AQ86VX9 555 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 ADSSL1Q8N142 457 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 SNX25Q9H3E2 840 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.33■■□□□ 1.17
PHF23-210ENST00000574407 PHACTR2O75167 634 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 RHOBTB3O94955 611 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ATICP31939 592 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 PLCB2Q00722 1185 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 VSTM1Q6UX27 236 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SLC22A12Q96S37 553 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TDP1Q9NUW8 608 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 EML5Q05BV3 1969 aa22.32■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 VNN1O95497 513 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 GRIK1P39086 918 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 RAP1GAPP47736 663 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 CACNA2D1P54289 1103 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 USP46P62068 366 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 GAS6Q14393 721 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ZNF699Q32M78 642 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SPATA17Q96L03 361 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 HPS4Q9NQG7 708 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.31■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SOBPA7XYQ1 873 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 FAM163BP0C2L3 166 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 AP3M2P53677 418 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 NCOA4Q13772 614 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 CEP135Q66GS9 1140 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 NELL1Q92832 810 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 CHFRQ96EP1 664 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 IER2Q9BTL4 223 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SDCBP2Q9H190 292 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 GKN1Q9NS71 199 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.3■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 C2orf78A6NCI8 922 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 A8MXQ7 604 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 F8VP50 259 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TRIM66O15016 1216 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ZNF202O95125 648 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TDGF1P13385 188 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ANXA13P27216 316 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 CDH8P55286 799 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 PON2Q15165 354 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 Q6ZS52 159 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 EBF3Q9H4W6 596 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.29■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.28■■□□□ 1.16
PHF23-210ENST00000574407 CLDN5O00501 218 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms