RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 MYL6P60660 151 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 SATB1Q01826 763 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 STK4Q13043 487 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 PSMD2Q13200 908 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 RUNX3Q13761 415 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 DCLK2Q8N568 766 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ZNF516Q92618 1163 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 NELL1Q92832 810 aa23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 TRIM66O15016 1216 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 KLRC4O43908 158 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 TACC1O75410 805 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 TADA3O75528 432 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 FAM163BP0C2L3 166 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 USP17L7P0C7H9 530 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ATICP31939 592 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CASP4P49662 377 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 KCNB1Q14721 858 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 Q6ZS52 159 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 PCED1BQ96HM7 432 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 SPATA17Q96L03 361 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.19■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.19■■□□□ 1.3
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CIPC-208ENST00000557115 A8MXQ7 604 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 LILRB5O75023 590 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 AP3M2P53677 418 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 AMPD2Q01433 879 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 GAS6Q14393 721 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 EPC1Q9H2F5 836 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 HPS4Q9NQG7 708 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 EHD2Q9NZN4 543 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 RAB23Q9ULC3 237 aa23.18■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 MYL1P05976 194 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ARSAP15289 507 aa23.17■■□□□ 1.3
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CIPC-208ENST00000557115 HDCP19113 662 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 SYKP43405 635 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 PDE6CP51160 858 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 MTF1Q14872 753 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 PDGFRLQ15198 375 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 SYNPOQ8N3V7 929 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.17■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 DMDP11532 3685 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 C2orf78A6NCI8 922 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 F8VP50 259 aa23.16■■□□□ 1.3
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CIPC-208ENST00000557115 IFNAR2P48551 515 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ZNF699Q32M78 642 aa23.16■■□□□ 1.3
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CIPC-208ENST00000557115 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 SLC22A12Q96S37 553 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.16■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 NCOA4Q13772 614 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CCINQ13939 588 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 WDR44Q5JSH3 913 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CEP135Q66GS9 1140 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 CPA6Q8N4T0 437 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 RIN3Q8TB24 985 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 EXOC4Q96A65 974 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.15■■□□□ 1.3
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CIPC-208ENST00000557115 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.15■■□□□ 1.3
CIPC-208ENST00000557115 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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CIPC-208ENST00000557115 KIF20AO95235 890 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 ABL1P00519 1130 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 NR3C1P04150 777 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 NDUFA8P51970 172 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 USP46P62068 366 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.14■■□□□ 1.29
CIPC-208ENST00000557115 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.14■■□□□ 1.29
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