RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547352.1

HECTD4-204, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 1,203 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-204ENST00000547352 NENFQ9UMX5 172 aa9.3□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.3□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ACKR2O00590 384 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 OGTO15294 1046 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CXCL14O95715 111 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CTAGE8P0CG41 777 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 KLRC1P26715 233 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PHKA2P46019 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ACOT2P49753 483 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 DSC3Q14574 896 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ACAP1Q15027 740 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PPM1JQ5JR12 505 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 BRICD5Q6PL45 260 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 GPR152Q8TDT2 470 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 TAS1R2Q8TE23 839 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SEMA4DQ92854 862 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 FZD8Q9H461 694 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 NCDNQ9UBB6 729 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.29□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 MYH10P35580 1976 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ENC1O14682 589 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 BUB1O43683 1085 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 HLA-DRAP01903 254 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 EDN1P05305 212 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 TMEM253P0C7T8 217 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SDHBP21912 280 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 USP8P40818 1118 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CLCN3P51790 818 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRR20EP86478 221 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRR20CP86479 221 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRR20DP86480 221 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRR20BP86481 221 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRR20AP86496 221 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CDC42EP1Q00587 391 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 GCNT1Q02742 428 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 MCL1Q07820 350 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 BIRC3Q13489 604 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ELF2Q15723 593 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 FAM187BQ17R55 369 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ZACNQ401N2 412 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 FAM71AQ8IYT1 594 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 HELQQ8TDG4 1101 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SHC3Q92529 594 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 RABGGTAQ92696 567 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF558Q96NG5 402 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SYT11Q9BT88 431 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 ZBP1Q9H171 429 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 SPG21Q9NZD8 308 aa9.28□□□□□ -0.92
HECTD4-204ENST00000547352 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms