RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545698.1

TDG-210, Transcript of thymine DNA glycosylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TDG, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDG-210ENST00000545698 KCNB1Q14721 858 aa20.36■□□□□ 0.85
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TDG-210ENST00000545698 RNF43Q68DV7 783 aa20.36■□□□□ 0.85
TDG-210ENST00000545698 OSTM1Q86WC4 334 aa20.36■□□□□ 0.85
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TDG-210ENST00000545698 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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TDG-210ENST00000545698 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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TDG-210ENST00000545698 BDNFP23560 247 aa20.3■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 VSTM1Q6UX27 236 aa20.3■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 C11orf74Q86VG3 221 aa20.3■□□□□ 0.84
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