RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523868.2

CLVS1-210, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-210ENST00000523868 LNP1A1A4G5 178 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLVS1-210ENST00000523868 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-210ENST00000523868 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-210ENST00000523868 STK17AQ9UEE5 414 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-210ENST00000523868 EBF1Q9UH73 591 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-210ENST00000523868 SIX4Q9UIU6 781 aa7.29□□□□□ -1.24
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