RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 RCVRNP35243 200 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RAP1GDS1P52306 607 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ARL4CP56559 192 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GTF2IP78347 998 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MECOMQ03112 1051 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DMPKQ09013 629 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ECM1Q16610 540 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ARSHQ5FYA8 562 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TMC7Q7Z402 723 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ERMNQ8TAM6 284 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TEKT1Q969V4 418 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SKA1Q96BD8 255 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM11Q96F44 468 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CNBD2Q96M20 576 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CSRNP1Q96S65 589 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TIMM22Q9Y584 194 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FUOMA2VDF0 154 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NDC80O14777 642 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 PDE8BO95263 885 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RRM1P23921 792 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NR2F2P24468 414 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ADCY8P40145 1251 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 LMNB2Q03252 620 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 RASA2Q15283 850 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SIX2Q9NPC8 291 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DMTF1Q9Y222 760 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 F8W8V4 182 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 STRNO43815 780 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CFHP08603 1231 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM253P0C7T8 217 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MYL2P10916 166 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 KRT4P19013 534 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 IVDP26440 423 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 EPHB1P54762 984 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 NCKAP1LP55160 1127 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CLDN10P78369 228 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CDK16Q00536 496 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CYTH1Q15438 398 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TPK1Q9H3S4 243 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 S100A14Q9HCY8 104 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GCNT4Q9P109 453 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TM7SF2O76062 418 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FUCA1P04066 466 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 GYG1P46976 350 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ATP1A4Q13733 1029 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 DCAF6Q58WW2 860 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 OGFOD2Q6N063 350 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF410Q86VK4 478 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MORC4Q8TE76 937 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 SLC39A7Q92504 469 aa8.55□□□□□ -1.04
CLVS1-204ENST00000518858 MAML3Q96JK9 1138 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms