RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 E2F2Q14209 437 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQCB1Q15051 598 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYDE2Q5VT97 1194 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIER2Q8N344 545 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 TERB1Q8NA31 727 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 CIPCQ9C0C6 399 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCHO1O14526 889 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCLK1O15075 740 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 RENBPP51606 427 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SATB1Q01826 763 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 GHRHRQ02643 423 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITKQ08881 620 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOGQ13253 232 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMOTQ4VCS5 1084 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC157Q569K6 752 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTMR8Q96EF0 704 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX18Q96RF0 628 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHTN1A0MZ66 631 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM232C9JQI7 657 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 DTNBO60941 627 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCATO75600 419 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRF1P14222 555 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADKP55263 362 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BNX3 289 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC16A6O15403 523 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF8O76064 485 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNC5CO95185 931 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCND1P24385 295 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 FPR3P25089 353 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM187BQ17R55 369 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 GIMAP6Q6P9H5 292 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 COQ8BQ96D53 544 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARK4Q96L34 752 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 SQORQ9Y6N5 450 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC3P53804 2025 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD8B2A6NJW9 211 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BUI4 141 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 AP4M1O00189 453 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 OAZ2O95190 189 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALPLP05186 524 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKCBP05771 671 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRPP07492 148 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 TYRP14679 529 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGS19P49795 217 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE6CP51160 858 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 HK3P52790 923 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 E2F1Q01094 437 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF91Q05481 1191 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN21Q16825 1174 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS33BQ9H267 617 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 POT1Q9NUX5 634 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms