RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SLC22A12Q96S37 553 aa24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 GKN1Q9NS71 199 aa24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 OBP2AQ9NY56 170 aa24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.2■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
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SENP6-211ENST00000493959 PRR23AA6NEV1 266 aa24.19■■□□□ 1.46
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SENP6-211ENST00000493959 FAM163BP0C2L3 166 aa24.19■■□□□ 1.46
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SENP6-211ENST00000493959 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 USP46P62068 366 aa24.19■■□□□ 1.46
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SENP6-211ENST00000493959 KCNB1Q14721 858 aa24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SV2AQ7L0J3 742 aa24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 33.5
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SENP6-211ENST00000493959 FRYLO94915 3013 aa24.19■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 A8MXQ7 604 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 AKAP3O75969 853 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 AP3M2P53677 418 aa24.18■■□□□ 1.46
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SENP6-211ENST00000493959 ZNF699Q32M78 642 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 WDR44Q5JSH3 913 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TSSK4Q6SA08 328 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TMC2Q8TDI7 906 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ATG2BQ96BY7 2078 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.18■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 NCAM2O15394 837 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 LAMTOR5O43504 91 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 AVPR1AP37288 418 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 NUCB2P80303 420 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 MTAPQ13126 283 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ZACNQ401N2 412 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 VSTM1Q6UX27 236 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SPATA17Q96L03 361 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TDP1Q9NUW8 608 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.17■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 C2orf78A6NCI8 922 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 F8VP50 259 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 CLSTN1O94985 981 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 CHRNB1P11230 501 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 NR2F2P24468 414 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 VAMP7P51809 220 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 FANCMQ8IYD8 2048 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TRIM49P0CI25 452 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TRIM49CP0CI26 452 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 PPP3CAQ08209 521 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ORC1Q13415 861 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ADAM9Q13443 819 aa24.15■■□□□ 1.46
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SENP6-211ENST00000493959 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 TTC16Q8NEE8 873 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 HPS4Q9NQG7 708 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 GCNT4Q9P109 453 aa24.15■■□□□ 1.46
SENP6-211ENST00000493959 IKBKBO14920 756 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 KIF20AO95235 890 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 HLA-DRAP01903 254 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 ARSAP15289 507 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 CTHP32929 405 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 GCLMP48507 274 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 NFIL3Q16649 462 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.14■■□□□ 1.45
SENP6-211ENST00000493959 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.14■■□□□ 1.45
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