RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PHKB	Q93100	1093 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CFTR	P13569	1480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	VPS4B	O75351	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	GC	P02774	474 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC5A1	P13866	664 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	BRAF	P15056	766 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PPP3CB	P16298	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PROZ	P22891	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	KLRC1	P26715	233 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LRPAP1	P30533	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ADRA1B	P35368	520 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FOXI1	Q12951	378 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FHL2	Q14192	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	LPIN2	Q92539	896 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809		F5H697	171 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TPM2	P07951	284 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CHRM3	P20309	590 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	CD6	P30203	668 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	COL10A1	Q03692	680 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ICE2	Q659A1	982 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HBP1-211	ENST00000483809	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	USP47	Q96K76	1375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809		A0A087X1B8	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	MYO1C	O00159	1063 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	YY2	O15391	372 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	CCP110	O43303	1012 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	PEX1	O43933	1283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	RAMP2	O60895	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	MYL1	P05976	194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	LILRA4	P59901	499 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	TGFB2	P61812	414 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	SATB1	Q01826	763 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.71	□□□□□ -1.66
HBP1-211	ENST00000483809	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66

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