RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482507.5

ATG4B-220, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-220ENST00000482507 NR1H3Q13133 447 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.63■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 MSCO60682 206 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CCNA1P78396 465 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SPARCL1Q14515 664 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PDK4Q16654 411 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 GPR142Q7Z601 462 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ERICH1Q86X53 443 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ERP27Q96DN0 273 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 STAM2O75886 525 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CD48P09326 243 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CA4P22748 312 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SSTR1P30872 391 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SLC18A1P54219 525 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 INHBEP58166 350 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TFDP1Q14186 410 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 EFHC2Q5JST6 749 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 WDR49Q8IV35 697 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 KIRREL3Q8IZU9 778 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ACTL9Q8TC94 416 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CPT1BQ92523 772 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TMEM237Q96Q45 408 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SMC6Q96SB8 1091 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ZWILCHQ9H900 591 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CREBZFQ9NS37 354 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 C15orf41Q9Y2V0 281 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.62■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ABLIM1O14639 778 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ICAM3P32942 547 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ASPAP45381 313 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TM4SF4P48230 202 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 NRLP54845 237 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 STXBP2Q15833 593 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CENPUQ71F23 418 aa15.61■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 LRCH4O75427 683 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 T-ENOLP0DO92 83 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SREBF2Q12772 1141 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 DNERQ8NFT8 737 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 C10orf82Q8WW14 230 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 POLIQ9UNA4 740 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 KRT4P19013 534 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ORC1Q13415 861 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TAF5Q15542 800 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 HIF1AQ16665 826 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 C17orf99Q6UX52 265 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 EMC1Q8N766 993 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TCHPQ9BT92 498 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CYLDQ9NQC7 956 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 HAO1Q9UJM8 370 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.6■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 CST8O60676 142 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-220ENST00000482507 TOM1L1O75674 476 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms