RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V0D1P61421 351 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 DR1Q01658 176 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 PFKPQ01813 784 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 KCNMA1Q12791 1236 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 SLC29A2Q14542 456 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 STAT4Q14765 748 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 PDK4Q16654 411 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.51□□□□□ -1.21
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PKP4-211ENST00000481115 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TTC23LQ6PF05 361 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 VSTM1Q6UX27 236 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CENPUQ71F23 418 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TDRPQ86YL5 185 aa7.51□□□□□ -1.21
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PKP4-211ENST00000481115 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ESR2Q92731 530 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 HES6Q96HZ4 224 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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PKP4-211ENST00000481115 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 USP29Q9HBJ7 922 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 VPS45Q9NRW7 570 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 GID8Q9NWU2 228 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 HAO1Q9UJM8 370 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 RAB26Q9ULW5 256 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 STX8Q9UNK0 236 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TAF1P21675 1872 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CACNA1SQ13698 1873 aa7.51□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TMEM114B3SHH9 223 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ALOX15BO15296 676 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 GYG2O15488 501 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 NCK2O43639 380 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 RASGRP1O95267 797 aa7.5□□□□□ -1.21
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PKP4-211ENST00000481115 M6PRP20645 277 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 EPHB2P29323 1055 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MAN1A1P33908 653 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 PRKCIP41743 596 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 BCAP31P51572 246 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ACTR3P61158 418 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CLCQ05315 142 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 MAPK7Q13164 816 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 SPARCL1Q14515 664 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TNIP1Q15025 636 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 KYNUQ16719 465 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CENPPQ6IPU0 288 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CGB2Q6NT52 195 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 GK5Q6ZS86 529 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.5□□□□□ -1.21
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PKP4-211ENST00000481115 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 SYNE4Q8N205 404 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CCDC89Q8N998 374 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 C10orf82Q8WW14 230 aa7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PKP4-211ENST00000481115 USP6NLQ92738 828 aa7.5□□□□□ -1.21
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