RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.09□□□□□ -0.95
CTPS1-208ENST00000479480 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 PATE3B3GLJ2 98 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 PLCG1P19174 1290 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 BCKDHBP21953 392 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ZXDBP98169 803 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CREB5Q02930 508 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCB1Q12824 385 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 PSMD2Q13200 908 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 MTF1Q14872 753 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 PDGFRLQ15198 375 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF77Q15935 545 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 EML3Q32P44 896 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SYT13Q7L8C5 426 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CXorf38Q8TB03 319 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 RAD54LQ92698 747 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CD101Q93033 1021 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 PKMYT1Q99640 499 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 EDEM2Q9BV94 578 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 GCNT4Q9P109 453 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 EBF1Q9UH73 591 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 L1RE1Q9UN81 338 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 C2CD2Q9Y426 696 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.08□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ACACBO00763 2458 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf78A6NCI8 922 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 K7EQS6 105 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ATP2C2O75185 946 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 NOL4O94818 638 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 RHOBTB1O94844 696 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 APBB3O95704 486 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CSH1P0DML2 217 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CSH2P0DML3 217 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 DDIT3P35638 169 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 UBA7P41226 1012 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 DGKEP52429 567 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 IRX4P78413 519 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 AMPD2Q01433 879 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 FOXC1Q12948 553 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 GAB4Q2WGN9 574 aa9.07□□□□□ -0.96
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CTPS1-208ENST00000479480 EMC10Q5UCC4 262 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 USP49Q70CQ1 688 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 FRMD1Q8N878 549 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 USP33Q8TEY7 942 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 MYRFLQ96LU7 910 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 STRA6Q9BX79 667 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.07□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 CITO14578 2027 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 LNP1A1A4G5 178 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SOBPA7XYQ1 873 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ITGB3P05106 788 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 LMO2P25791 158 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 GBP1P32455 592 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 OPRD1P41143 372 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SLC6A11P48066 632 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 IFNAR2P48551 515 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SEC13P55735 322 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 TSPY1Q01534 308 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 MESP2Q0VG99 397 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 ELF2Q15723 593 aa9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CTPS1-208ENST00000479480 SV2CQ496J9 727 aa9.06□□□□□ -0.96
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